発酵野菜パウダーは、基本的に発酵させた食べものなので、薬学的な成分が含まれている訳ではありません。

従いまして、薬との併用には基本的に問題はないと考えられます。

仮に、「こういう系統の食べものは控えてください…」との指示が、ドクターから出されているのであれば、
それを考慮しなければなりませんが、そうした心配がないのであれば、大丈夫です。